Cagrilintide : structure, analytique et manipulation en recherche

Vue d’ensemble et dénomination

La cagrilintide (même graphie dans le catalogue et en anglais : Cagrilintide) est la dénomination commune internationale (DCI) d’un peptide de synthèse dérivé de l’amyline humaine. L’OMS a publié ce nom en 2020 dans la liste 123 des DCI proposées, avec pour désignation de classe « analogue de l’amyline ». GPeptides propose le réactif sous forme lyophilisée, en flacon contenant une quantité pesée de 10 mg.

• Numéro CAS : 1415456-99-3
• UNII : AO43BIF1U8
• CID PubChem : 171397054
• Formule brute : C194H312N54O59S2, masse molaire d’environ 4409,1 g/mol

Prudence lors de la comparaison avec les bases de données : le nom IUPAC calculé par PubChem indique des configurations D pour plusieurs résidus entre les positions 27 et 37 ; la DCI, le nom CAS et le registre de substances GSRS décrivent exclusivement des acides aminés L. Ne reprenez donc pas sans vérification le SMILES et l’InChIKey de cette entrée.

Structure en détail

Comme dans l’amyline humaine, le squelette comprend 37 acides aminés, notés par blocs de dix : KCNTATCATQ RLAEFLRHSS NNFGPILPPT NVGSNTP-NH2. Quatre caractéristiques marquent la molécule :

1. Six substitutions par rapport à l’amyline humaine : N14E, V17R, A25P, S28P, S29P et Y37P. L’acide glutamique 14 et l’arginine 17 sont distants de trois positions et se situent du même côté de l’hélice ; leurs chaînes latérales de charges opposées sont décrites comme un pont salin stabilisant l’hélice. L’amyline humaine tend à former des fibrilles amyloïdes, d’où son second nom IAPP (Islet Amyloid Polypeptide) ; les prolines en 25, 28 et 29, reprises de l’analogue pramlintide, s’intègrent mal dans les feuillets β.
2. Pont disulfure : Cys2 et Cys7 referment les résidus 2 à 7 en un cycle à 20 chaînons. L’OMS numérote d’après la protéine précurseur et écrit « (35-40)-disulfide » ; il s’agit du même pont.
3. Lipidation : sur le groupe α-amino de la lysine 1 est fixé, par l’intermédiaire d’un espaceur L-γ-glutamyle, le monoamide de l’acide eicosanedioïque, un acide dicarboxylique linéaire en C20. La chaîne hydrocarbonée rend la molécule amphiphile ; restent ionisables le groupe carboxyle en bout de chaîne, le groupe α-carboxyle de l’espaceur et le groupe ε-amino de la lysine.
4. Extrémité C-terminale : prolinamide au lieu de tyrosinamide ; la chaîne ne contient donc plus de tyrosine.

À pH neutre, le calcul oppose à la lysine 1, aux arginines 11 et 17 ainsi que, en partie, à l’histidine 18 trois carboxylates : l’acide glutamique 14, l’espaceur et l’extrémité de l’acide gras. La charge nette est proche de zéro.

Ce qui la distingue des molécules apparentées

• Amyline humaine (IAPP, DCI amlintide) : 37 résidus, Cys2–Cys7, tyrosinamide C-terminal, sans lipidation.
• Pramlintide : amyline humaine avec A25P, S28P et S29P. La cagrilintide reprend ces prolines et y ajoute N14E, V17R, Y37P ainsi que le diacide gras.
• Calcitonine de saumon : 32 résidus, pont disulfure Cys1–Cys7, également un prolinamide C-terminal ; un ligand de comparaison courant dans les travaux sur la liaison aux récepteurs.
• Analogues de l’incrétine comme le GLP-3 : ils ciblent les récepteurs du GLP-1, du GIP et, pour certains, du glucagon. Le GLP-3 partage avec la cagrilintide le diacide gras en C20, mais ni la séquence ni le récepteur cible.

Points d’attention pour l’analytique et le COA

1. Masse attendue : 4406,25 Da en masse monoisotopique, environ 4409,1 Da en masse moyenne. Par le calcul, à un peu plus de 4,4 kDa, le pic M+2 est environ trois fois plus intense que le pic monoisotopique ; vérifiez donc à quoi se rapporte une valeur déconvoluée. Une entrée de base de données indiquant O58 comporte une erreur de saisie ; seul O59 correspond à la masse qui y figure.
2. États de charge : sans extrémité N-terminale libre, des états de charge faibles sont plausibles en ionisation par électronébulisation ; sur la base de la masse moyenne, [M+3H]3+ à m/z ≈ 1470,7 et [M+4H]4+ à m/z ≈ 1103,3.
3. Pont disulfure : la forme réduite et ouverte est plus lourde de 2,02 Da, soit seulement 0,5 m/z dans l’ion à quatre charges. Avec un seul pont, un réarrangement intramoléculaire est exclu, mais des dimères peuvent se former par échange de disulfures. Leur ion à huit charges tombe au même m/z que le monomère à quatre charges, mais présente des pics isotopiques espacés de 0,125 au lieu de 0,25 m/z et se distingue en outre par le temps de rétention.
4. Lipidation : sans le diacide gras, la masse est inférieure de 324,27 Da ; sans le diacide gras ni l’espaceur, de 453,31 Da. La chaîne acyle allonge nettement la rétention en HPLC en phase inverse.
5. Désamidation et séquences erronées : cinq asparagines et la glutamine 10 peuvent se désamider (+0,98 Da) ; le motif Asn-Gly, particulièrement sensible, est absent. Les séquences erronées issues de la synthèse sont plus légères, par exemple de 97,05 Da (proline) ou de 114,04 Da (asparagine).
6. Oxydation et UV : la méthionine, le tryptophane et la tyrosine sont absents. Un signal à +16 Da est donc plus rare que pour de nombreux peptides ; à 280 nm, la molécule n’absorbe guère, et la pureté est donc généralement déterminée entre 210 et 220 nm.
7. Contre-ions : le trifluoroacétate (TFA) ou l’acétate se lient à la lysine, aux arginines et, le cas échéant, à l’histidine ; quatre molécules d’acide liées augmentent la masse de formule d’environ 456 g/mol (TFA) ou 240 g/mol (acide acétique). La pureté HPLC, part de surface du pic principal, n’en tient pas compte ; la teneur nette en peptide se rapporte à la totalité de la quantité pesée.

L’identité et la pureté de Cagrilintide sont contrôlées régulièrement en externe par HPLC et spectrométrie de masse. Les certificats d’analyse (COA) disponibles figurent dans l’espace laboratoire ; en l’absence de certificat déposé, le contrôle y est signalé « en attente ». Les guides HPLC et spectrométrie de masse et Bien lire un certificat d’analyse expliquent comment interpréter le chromatogramme et le spectre de masse d’un certificat.

Stockage et manipulation au laboratoire

Conservez le lyophilisat au sec, à l’abri de la lumière et au frais, à −20 °C ou plus froid pour un stockage prolongé. Laissez un flacon réfrigéré revenir, fermé, à température ambiante avant de l’ouvrir, afin qu’aucune condensation ne se forme. S’y ajoutent des points propres à la molécule :

• Amphiphilie : en solution, les peptides lipidés peuvent tendre à l’auto-association et adhérer aux surfaces.
• Agents réducteurs : le DTT ou le TCEP ouvrent le pont disulfure et ne conviennent pas aux expériences portant sur la molécule intacte.
• pH : les conditions alcalines favorisent l’échange de disulfures et la désamidation.

Mieux vaut répartir les solutions en aliquotes que les congeler et décongeler à plusieurs reprises. Plus d’informations dans le guide Stocker des peptides lyophilisés.

Contexte de recherche

Le domaine de recherche de la cagrilintide est le système des récepteurs de l’amyline et de la calcitonine, étudié in vitro et dans des modèles précliniques. Le récepteur de la calcitonine (CTR) est un récepteur couplé aux protéines G de classe B ; associé à RAMP1, RAMP2 ou RAMP3, il forme les récepteurs de l’amyline AMY1R, AMY2R et AMY3R. La cagrilintide est décrite comme un agoniste non sélectif du CTR et des trois récepteurs de l’amyline ; les travaux portent par exemple sur la liaison et la transduction du signal dans des systèmes cellulaires.

Réservé à la recherche : mention légale

Chez GPeptides, Cagrilintide est disponible exclusivement comme réactif de laboratoire pour des expériences in vitro. Le produit n’est pas destiné à être utilisé sur l’être humain ou l’animal et n’est pas commercialisé comme médicament. GPeptides ne se prononce ni sur l’utilisation ni sur l’effet ; les rapports d’analyse documentent uniquement l’identité et la pureté. Le prix et la disponibilité figurent sur la page produit Cagrilintide, les molécules apparentées dans la catégorie Analogues de l’incrétine.